Changeset 192 for vnmr_recon/epi_recon.m


Ignore:
Timestamp:
Feb 14, 2012, 2:01:02 PM (7 years ago)
Author:
tjniskan
Message:
  • Fixed a bug in EPIP reconstruction with partial kspace.

M aedes_revision.m
M vnmr_recon/epi_recon.m

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • vnmr_recon/epi_recon.m

    r177 r192  
    154154        orient = procpar.orient{1};
    155155       
    156         if isEPIP && (nv==64 & np==64)
     156        % Detect partial fourier EPI
     157        if isfield(procpar,'fract_ky') && procpar.fract_ky~=nv/2
     158                nv_full = nv;
     159                nv = nv/2+procpar.fract_ky;
     160        elseif isEPIP && isfield(procpar,'kzero') && procpar.kzero~=0
     161                nv_full = nv;
     162                nv = nv/2+procpar.kzero;
     163        else
     164                nv_full = nv;
     165        end
     166       
     167        if isEPIP && (nv_full==64 & np==64)
    157168                % The information about navigator echoes in the procpar doesn't seem to
    158169                % be consistent. This code tried to guess the number of navigators from
    159170                % the k-space size
    160171                nNav = size(kspace,1)/np-nv;
    161         end
    162        
    163         % Detect partial fourier EPI
    164         if isfield(procpar,'fract_ky') && procpar.fract_ky~=nv/2
    165                 nv_full = nv;
    166                 nv = nv/2+procpar.fract_ky;
    167         else
    168                 nv_full = nv;
    169172        end
    170173       
     
    176179                NavInd = NavInd(:).';
    177180                DataInd = DataInd(:).';
     181               
     182                % Warn that navigator echoes are not used...
     183                warning('Navigator correction has not been implemented. All navigator echoes are ignored.');
    178184        else
    179185                DataInd = [1:nv];
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.

Powered by Trac 1.0.9.Copyright © Juha-Pekka Niskanen 2008